Nhận thức rõ tầm quan trọng về công tác Bảo vệ bí mật Nhà nước (BMNN), trong thời gian qua Sở Tài nguyên và Môi trường (TN&MT) tỉnh Phú Thọ đã thường xuyên quan tâm, lãnh đạo, chỉ đạo thực hiện nghiêm túc công tác bảo vệ bí mật Nhà nước tại cơ quan, làm tốt công tác tuyên truyền, quán triệt công tác bảo vệ bí mật Nhà nước tại các hội nghị, các cuộc họp, đồng thời in sao gửi bằng các văn bản đến các phòng, ban, đơn vị thuộc, trực thuộc Sở và đến từng công chức, viên chức, người lao động để thực hiện, cụ thể như: Pháp lệnh bảo vệ bí mật Nhà nước 2000, Nghị định số 33/2002/NĐ-CP ngày 28/3/2002 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành Pháp lệnh Bảo vệ bí mật Nhà nước; Chỉ thị số 13/2008/CT-TTg ngày 11/4/2008 của thủ tướng Chính phủ về công tác bảo vệ BMNN; Thông tư số 12/2002/TT-BCA ngày 13/9/2002 của Bộ Công an về hướng dẫn thực hiện Nghị định số 33/2002/NĐ-CP ngày 28/3/2002 của Chính phủ; Chỉ thị số 05/CT/TTg, ngày 21/2/2012, của Thủ tướng Chính phủ về nâng cao chất lượng, hiệu quả công tác bảo vệ BMNN trong tình hình mới; Chỉ thị 28-CT/TW, ngày 16/9/2013 của Ban bí thư về tăng cường công tác bảo đảm an toàn thông tin mạng; Chỉ thị 15/CT-TTg, ngày 17/6/2014 của Thủ tướng Chính phủ về tăng cường công tác bảo đảm an ninh và an toàn thông tin mạng trong tình hình mới; Quyết định số 2398/2003/QĐ-UB ngày 25/6/2003 của UBND tỉnh về ban hành Quy chế  bảo vệ BMNN và Kế hoạch 264/KH-BCA-A68, ngày 29/8/2014 của Bộ Công an về tăng cường công tác bảo vệ an ninh, an toàn hệ thống mạng thông tin quốc gia. Đồng thời, yêu cầu lãnh đạo các phòng, đơn vị trực thuộc Sở quán triệt và thực hiện tốt công tác bảo vệ bí mật Nhà nước, đối chiếu với danh mục bí mật nhà nước quy định của ngành Tài nguyên và Môi trường; phổ biến cụ thể những nội dung nghiêm cấm đối với cán bộ, công chức, viên chức về lĩnh vực liên quan đến bí mật Nhà nước. 

Sở đã chỉ đạo xây dựng hệ thống các văn bản cụ thể hóa các quy định về công tác bảo vệ BMNN như:

Quyết định số 145/QĐ-TNMT ngày 06/11/2013 ban hành Quy chế Bảo vệ bí mật Nhà nước của Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Phú Thọ

 Quyết định số 142/QĐ-TNMT ngày 30/10/2013 ban hành Quy chế quản lý, sử dụng mạng máy tính nội bộ, Internet và Trang thông tin điện tử của Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Phú Thọ. 

Sở đã thành lập Ban chỉ đạo công tác bảo vệ BMNN tại Quyết định số 143/QĐ-TNMT ngày 05/11/2013; quyết định ban hành Quy chế hoạt động của Ban chỉ đạo tại quyết định số 164/QĐ-BCĐ ngày 16/12/2013; thành lập Tổ giúp việc Ban chỉ đạo tại Quyết định số 165/QĐ-BCĐ ngày 16/12/2013. Sở đã yêu cầu toàn thể công chức, viên chức và người lao động trong cơ quan ký bản cam kết bảo vệ bí mật Nhà nước. 

Hàng năm Sở TN&MT Phú Thọ xây dựng Kế hoạch bảo vệ BMNN, tổ chức thực hiện và báo cáo kết quả thực hiện công tác Bảo vệ bí mật Nhà nước với Ban chỉ đạo của tỉnh theo quy định.