Đoàn thanh tra đã phối hợp với phòng TNMT cấp huyện nơi có cơ sở thuộc đối tượng thanh tra và tiến hành thanh tra công tác bảo vệ môi trường đối với 06 cơ sở: Công ty cổ phần cơ khí giao thông vận tải Phú Thọ, Bệnh viện xây dựng Việt Trì, Công ty cổ phần sắn Sơn Sơn, Nhà máy chế biến tinh bột sắn của Chi nhánh Việt Trì - Công ty cổ phần lương thực và thương mại Phú Thọ, Công ty cổ phần Giấy lửa Việt, Công ty cổ phần Kovi.

Qua thanh tra thấy:

Các cơ sở đã có ý thức trong công tác bảo vệ môi trường như: Đầu tư xây dựng hệ thống xử lý nước thải, khí thải và các công tác bảo vệ môi trường khác theo quy định như quan trắc môi trường định kỳ, đăng ký chủ nguồn thải chất thải nguy hại với cơ quan có thẩm quyền, quản lý chất thải rắn thông thường theo đúng quy định...Tuy nhiên còn có cơ sở chưa đầu tư xây dựng hoàn chỉnh hệ thống xử lý nước thải hoặc khi hệ thống xử lý nước thải bị sự cố chưa có biện pháp khắc phục kịp thời nên nước thải khi thải ra môi trường chưa đảm bảo tiêu chuẩn theo cam kết tại Báo cáo ĐTM và quyết định phê duyệt báo cáo ĐTM của cơ quan có thẩm quyền, chưa thực hiện quan trắc môi trường định kỳ hoặc thực hiện nhưng không đầy đủ về tần suất quan trắc theo báo cáo ĐTM và quyết định phê duyệt ĐTM đã được cơ quan có thẩm quyền phê duyệt, quản lý chất thải nguy hại chưa đúng theo quy định, chưa đăng ký phát sinh chủ nguồn thải chất thải nguy hại, chưa kê khai nộp phí bảo vệ môi trường... Trên cơ sở các vi phạm của đơn vị, Đoàn thanh tra đã lập biên bản vi phạm hành chính đối với 05 cơ sở và chuyển  Chánh thanh tra Sở TNMT xử phạt theo thẩm quyền đối với 04 cơ sở, tổng số tiền 60 triệu đồng và chuyển hồ sơ vi phạm hành chính của Công ty cổ phần Giấy Lửa Việt đến Chủ tịch UBND tỉnh để xử phạt theo thẩm quyền, Chủ tịch UBND tỉnh đã ra quyết định xử phạt 52 triệu đồng.

Qua thanh tra, Đoàn thanh tra đã yêu cầu các cơ sở phải khắc phục ngay các tồn tại, các vi phạm trong công tác bảo vệ môi trường mà Đoàn thanh tra đã kiến nghị đối với từng cơ sở và thực hiện đúng, đầy đủ các các nội dung trong Báo cáo đánh giá tác động môi trường, Quyết định phê duyệt Báo cáo đánh giá tác động môi trường của cơ quan có thẩm quyền.

Thông qua thanh tra góp phần nâng cao nhận thức của các cơ sở đối với công tác bảo vệ môi trường, giúp các cơ sở thấy được tầm quan trọng của công tác bảo vệ môi trường, đồng thời kiến nghị các cơ quan quản lý nhà nước tăng cường công tác tuyên truyền, phổ biến pháp luật về bảo vệ môi trường đến các cơ sở và nhân dân trên địa bàn; tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra về bảo vệ môi trường và có biện pháp xử lý nghiêm khắc đối với những cơ sở có hành vi vi phạm công tác bảo vệ môi trường theo Luật Bảo vệ Môi trường. Nghị định số 117/2009/NĐ-CP ngày 31/12/2009 của Chính phủ quy định về xử lý vi phạm hành chính trong lĩnh vực bảo vệ môi trường và Luật.