Sản phẩm của Tổng công ty giấy chủ yếu là giấy viết, in và photocopy, ngoài ra Tổng công ty giấy còn sản xuất Clo với công xuất 6.500 tấn/năm và xút với công xuất 7.000 tấn/năm chủ yếu để cung cấp cho quá trình tẩy trắng bột giấy. Nguyên liệu sản xuất chính là tre, gỗ, bột giấy trong nước và nhập ngoại; Hóa chất sử dụng: CaCO3, NaSO4, H2O2, NaCl và Oxy... Nhiên liệu sử dụng: dầu FO, Than.


Trong thời gian hoạt động từ 1982 - 2003 việc thực hiện các biện pháp bảo vệ môi trường của Tổng công ty chưa được đầu tư đúng mức, đặc biệt là Hồ bùn vôi có hiện tượng nước thải thẩm thấu vào đất gây ảnh hưởng đến nước giếng của nhân dân xã Phú Nham; khí thải phát sinh từ công đoạn nấu bột giấy chưa được xử lý triệt để gây mùi khó chịu và nước thải phát sinh trong quá trình sản xuất chưa đáp ứng được so với tiêu chuẩn quy định. Trong những năm vừa qua Tổng Công ty Giấy Việt Nam đã quan tâm, nỗ lực đầu tư kinh phí xây dựng các công trình xử lý triệt để ô nhiễm theo yêu cầu tại Quyết định số 64/2003/QĐ-TTg của Chính phủ.


Đối với nước thải: Trước năm 2003 hệ thống xử lý nước thải chỉ bao gồm xử lý cơ, hoá học bằng phương pháp bông kết lắng có điều chỉnh pH. Hệ thống này nước thải sản xuất chỉ được điều chỉnh pH và xử lý chất rắn lơ lửng. Đến nay Tổng công ty đã áp dụng rất nhiều các biện pháp để khép kín nguồn thải, giảm thiểu lượng nước thải, tải lượng các chất ô nhiễm ra môi trường và làm tốt khâu xử lý cuối đường ống.


Thực hiện khép kín toàn bộ nước thải có chứa chất ô nhiễm vào cống ngầm để đưa về hệ thống xử lý nước thải tập trung và khảo sát cân bằng nước toàn Tổng công ty nhằm kiểm soát lưu lượng nước cấp và nước thải phát sinh trong quá trình sản xuất.


Đã đầu tư 149 tỷ đồng để cải tạo công nghệ tẩy trắng, bổ sung thêm giai đoạn loại lignin bằng ôxy để làm trắng bột giấy, làm giảm 15 kg Clo/Tấn bột, tuần hoàn lại nước rửa bột ở giai đoạn tẩy bằng ôxy để mang đi chưng bốc và đốt, giảm 50 % COD trong nước thải bộ phận tẩy. Đầu tư 900 triệu đồng để lót đáy chống thấm và kè bờ cho hồ chứa nước thải khẩn cấp để tránh ảnh hưởng đến nước ngầm cho khu vực xung quanh. Đặc biệt đã đầu tư 100 tỷ đồng để hoàn thiện hệ thống xử lý nước thải, công suất thiết kế là 30.000 m3/ngày đêm với công nghệ tiên tiến, hiện đại của công nghệ xử lý nước thải ngành giấy thế giới.


Ngoài ra Công ty còn thực hiện nhiều biện pháp nhằm giảm thiểu nước thải như: tái sử dụng nước ở phân xưởng bột và xeo; tận dụng nước làm mát để rửa nguyên liệu, vệ sinh nhà xưởng, dự phòng cứu hoả; thu hồi nước ngưng từ các bộ phận sấy giấy, cô đặc dịch... để tái sử dụng đã giảm được 50 m3  nước/tấn giấy thành phẩm.

Hiện tại Tổng công ty có  02 nguồn nước thải không được đưa về hệ thống xử lý là nước thải làm mát thiết bị từ sản xuất điện, hơi được xử lý sơ bộ bằng bể lắng rồi thải ra mương Phú Nham và nước thải từ công đoạn rửa nguyên liệu được thải ra mương thủy lợi sử dụng làm nước tưới phục vụ sản xuất nông nghiệp, kết quả phân tích cho thấy các chỉ tiêu đều nằm trong tiêu chuẩn cho phép.


Với những nỗ lực và được đầu tư thích đáng, nước thải của Tổng Công ty Giấy Việt Nam đã được xử lý đảm bảo Quy chuẩn kỹ thuật quốc gia đối với nước thải của ngành giấy.


Đối với khí thải: Công ty đã có hệ thống lọc bụi tĩnh điện xử lý khí thải phát sinh từ lò hơi đốt than và lò hơi thu hồi, hiệu suất thu hồi bụi đạt trên 95%. Tổng Công ty Giấy Việt Nam đã đầu tư 141 tỷ đồng trang bị thiết bị thay thế hệ thống chưng bốc dịch trực tiếp bằng hệ thống chưng bốc dịch gián tiếp, trang bị thiết bị giảm thiểu mùi khó chịu của hãng Kvaerner - Thuỵ Điển. Đầu tư cải tạo hệ thống thu hồi nhiệt của hơi phóng bột để giảm lượng khí thải và mùi khí thải từ bộ phận này với kinh phí là 3 tỷ đồng. Do đó hàm lượng khí mang mùi trong khói thải lò thu hồi đã giảm được hơn 90%. Chất lượng khí thải của Công ty đã được kiểm soát và đảm bảo Quy chuẩn thải.


Đối với chất thải rắn: Chất thải rắn phát sinh trong quá trình hoạt động sản xuất của Tổng công ty hiện đang được quản lý, thu gom, xử lý theo đúng quy định. Riêng đối với bùn vôi phát sinh trong quá trình sản xuất, trước đây được vận chuyển bằng cách pha loãng với nước sau đó bơm vào đường ống chảy ra hồ chứa nay đã được làm khô sau đó dùng ô tô chở ra đổ tại hồ bùn vôi (biện pháp này đã giảm được rất nhiều thể tích của bùn vôi cần thải). Năm 2004, Tổng công ty đã được UBND tỉnh giao đất để làm hồ bùn vôi mới. Trong quá trình thi công xây dựng và vận hành hồ bùn vôi mới, ngoài những biện pháp bắt buộc theo yêu cầu thiết kế, Tổng công ty đã thực hiện nhiều biện pháp nhằm đảm bảo môi trường khu vực hồ bùn vôi: làm mương thoát nước mưa xung quanh hồ bùn vôi để giảm lượng nước ngoại lai vào hồ gây quá tải cho hồ; xây dựng trạm bơm nước tự động để bơm nước từ hồ bùn vôi về hệ thống xử lý nước thải không để chảy tràn ra môi trường; thả bèo tây để tăng khả năng tự làm sạch nước trong hồ bùn vôi và dùng đất lấp bớt 1,8 ha diện tích hồ bùn vôi (khu vực giáp với các hộ dân) để tạo hành lang an toàn cho hệ thống nước ngầm khu vực.


Với những nỗ lực trong công tác bảo vệ môi trường, khắc phục và xử lý triệt để ô nhiễm môi trường, ngày 21/10/2009, Tổng Công ty Giấy Việt Nam đã được Sở Tài nguyên và Môi trường chứng nhận đã hoàn thành thực hiện các biện pháp xử lý triệt để theo Quyết định số 64/2003/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ.