Trung tâm đã tổ chức khảo sát, đo đạc và lấy mẫu phân tích các thông số môi trường tại các nguồn thải chính trong khu vực nghiên cứu của dự án có trong môi trường không khí, môi trường nước, môi trường đất với tổng số lượng mẫu lấy, vận chuyển và phân tích tại các vị trí đã được xác định là 442 mẫu các loại, trong đó có 152 mẫu khí thải, 210 mẫu nước thải các loại, 80 mẫu đất.


Từ kết quả quan trắc phân tích mẫu môi trường, nhập số liệu, tính toán chạy mô hình lan truyền ô nhiễm trong môi trường không khí, môi trường nước tại các nguồn thải cho thấy một số khu vực đang có dấu hiệu ô nhiễm môi trường như:


Khu vực Bắc Việt Trì (KCN Thụy Vân) và khu vực Nam Việt Trì bị ô nhiễm môi trường do khí thải và nước thải của một số đơn vị doanh nghiệp trong quá trình hoạt động không thực hiện xử lý triệt để chất thải trước khi thải ra ngoài môi trường. Bên cạnh đó còn có nguyên nhân do phát triển đô thị, cơ sở hạ tầng, hoạt động giao thông…


Khu vực Lâm Thao - Phù Ninh - TX.Phú Thọ: Môi trường không khí trong khoảng cự ly 1.500m về phía Tây, 800m về phía Tây Bắc, 1.000m về phía Bắc, phía Đông so với vị trí trung tâm nguồn thải Công ty supe phốt phát và hoá chất Lâm Thao đều chịu ảnh hưởng của ô nhiễm khí thải SO2, bụi thải vượt từ 1,1 - 2 lần TCCP và xung quanh khu lò gạch thủ công tập trung tại xã Thạch Sơn khu dân cư cách khu vực trung tâm các lò gạch cự ly 500m về phía Tây Bắc ô nhiễm khí CO vượt tiêu chuẩn cho phép từ 1,2 đến 1,8 lần, SO2 vượt TCCP từ 1,56 đến 2,1 lần, bụi vượt từ 1,1 đến 2,2 lần; khu vực xung quanh nguồn thải của Tổng Công ty Giấy Việt Nam chỉ bị ô nhiễm cục bộ trong cự ly 500m theo 4 hướng gió chủ đạo. Nước Sông Hồng tại các điểm tiếp nhận và trong vòng bán kính xuôi dòng 500m đến 1.000m so với cửa xả của Công ty Supe phốt phát và hoá chất Lâm Thao, hàm lượng TSS vượt tiêu chuẩn cho phép từ 1,06 đến 1,26 lần; COD vượt tiêu chuẩn cho phép từ 1,26 đến 1,8 lần; BOD vượt tiêu chuẩn cho phép từ 1,24 đến 1,76 lần; Tại vị trí cách cửa thải của Tổng công ty Giấy Việt Nam 100 m về phía thượng lưu có nồng độ BOD5 là 21mg/l; TSS là 58 mg/l; pH là 7,52; ô nhiễm về chất hữu cơ cục bộ ven bờ xung quanh điểm thải và xuôi xuống hạ lưu 1.000m của mương dẫn nước thải chung của thị xã Phú Thọ.


Khu vực Hạ Hoà - Thanh Ba: Xung quanh nguồn thải của Công ty CP Giấy Lửa Việt (huyện Hạ Hòa), công ty Cổ phần Xi măng Phú Thọ, Công ty Rượu Đồng Xuân (huyện Thanh Ba) nước thải, khí thải từ các Công ty này không được xử lý hoặc xử lý sơ bộ gây ô nhiễm môi trường trong khu vực. Khu vực Tam Nông môi trường không khí khu dân cư xung quanh làng nghề Mộc Minh Đức - xã Thanh Uyên, nồng độ bụi trong khu vực cự ly cách 200 m, 500 m về phía Tây Bắc bị ô nhiễm 0,37 - 0,39 mg/m3 vượt từ 1,2 - 1,3 lần TCCP.


Ngoài ra, các khu vực khác trong phạm vi nghiên cứu của dự án trên địa bàn tỉnh vẫn chưa có dấu hiệu ô nhiễm môi trường.


Tại các khu vực xác định khoanh vùng mức độ ô nhiễm môi trường, dự án đã tổng hợp xây dựng báo cáo chuyên đề về các vùng nhạy cảm đối với môi trường không khí, môi trường nước, môi trường đất; đề xuất một số giải pháp phòng ngừa hạn chế ô nhiễm và cải thiện môi trường tại các vùng nghiên cứu; xây dựng bản đồ khoanh vùng ô nhiễm tại các vùng nhạy cảm về môi trường trên địa bàn tỉnh; tổng hợp xây dựng các báo cáo toàn diện kết quả thực hiện dự án.


Ngày 29/10/2008, Sở Tài nguyên và Môi trường đã tổ chức Hội thảo lấy ý kiến đóng góp của các Sở, ngành liên quan; UBND các huyện, thành, thị vào báo cáo kết quả thực hiện dự án. Tại Hội nghị các thành viên đánh giá cao về các bước thực hiện và kết quả của dự án, đồng thời cũng đề nghị bổ sung, chỉnh sửa một số nội dung trong dự án. Sau Hội nghị, Sở Tài nguyên và Môi trường đã tổng hợp chỉnh sửa, bổ sung hoàn chỉnh những ý kiến đóng góp vào nội dung của dự án và trình UBND tỉnh và đã được Chủ tịch UBND tỉnh phê duyệt tại Quyết định số 4111/QĐ- UBND, ngày 31/12/2008.