Tuy nhiên, trong quá trình tổ chức thực hiện vẫn còn một số tồn tại, hạn chế, đó là: diện tích thửa sau dồn đổi còn nhỏ; mới chỉ tập trung chủ yếu thực hiện dồn đổi đối với diện tích trồng lúa; chưa thực hiện được đối với đất lâm nghiệp, đất bãi, đất nuôi trồng thủy sản; công tác chỉ đạo từ thị đến cơ sở còn hạn chế, thiếu quyết liệt; việc triển khai ở một số xã còn mang tính hình thức, chưa tạo được phong trào mạnh mẽ trong tổ chức thực hiện, dồn đổi ruộng đất chưa thực sự gắn với chuyển dịch cơ cấu trong sản xuất nông nghiệp…

Thực hiện Nghị quyết số 08-NQ/TU ngày 15/4/2016 của Ban Thường vụ Tỉnh ủy về “Công tác dồn đổi, tích tụ, tập trung đất đai phát triển sản xuất nông nghiệp trên địa bàn tỉnh đến năm 2020”; Chương trình hành động số 12-CTr/Th.U ngày 09/9/2016 của Ban Thường vụ Thị ủy Phú Thọ “Thực hiện nghị quyết số 08-NQ/TU ngày 15/4/2016 của Ban Thường vụ Tỉnh ủy về công tác dồn đổi, tích tụ và tập trung đất đai phát triển sản xuất nông nghiệp trên địa bàn tỉnh đến năm 2020”, UBND thị xã Phú Thọ đã xây dựng Kế hoạch số 576/KH-UBND ngày 13/7/2017 về “Thực hiện công tác dồn đổi, tích tụ và tập trung đất đai phát triển sản xuất nông nghiệp trên địa bàn thị xã Phú Thọ đến năm 2020”, với các chỉ tiêu cụ thể:

Chỉ tiêu thực hiện dồn đổi đất đai trên toàn thị xã đến năm 2020 đạt: 107,13 ha.

Chỉ tiêu thực hiện tích tụ đất đai trên toàn thị xã đến năm 2020 đạt: 255,0 ha.

Chỉ tiêu thực hiện tập trung đất đai trên toàn thị xã đến năm 2020 đạt: 252,34 ha. 

Để thực hiện hoàn thành các chỉ tiêu mà Kế hoạch của UBND thị xã Phú Thọ đã đề ra về dồn đổi, tích tụ và tập trung đất đai; từ nay đến năm 2020, các cấp uỷ Đảng, chính quyền, các phòng, ban cần tập trung lãnh đạo, chỉ đạo để tổ chức thực hiện tốt những nhiệm vụ như sau:

Cấp ủy, Chính quyền, Ban chỉ đạo thị xã phải thường xuyên kiểm tra, đôn đốc, sơ kết, tổng kết rút kinh nghiệm và tháo gỡ kịp thời những khó khăn, vướng mắc trong quá trình thực hiện.

Cấp ủy, chính quyền cấp xã phải trực tiếp lãnh đạo, chỉ đạo việc xây dựng và triển khai thực hiện phương án dồn đổi, tích tụ và tập trung đất đai cho phù hợp với tình hình thực tế tại địa phương.

Phòng Tài nguyên và Môi trường tổ chức hướng dẫn về chuyên môn, nghiệp vụ; Thường xuyên kiểm tra, đôn đốc thực hiện, tháo gỡ vướng mắc kịp thời.

Phòng Kinh tế hướng dẫn việc chuyển đổi cơ cấu cây trồng, vật nuôi cho từng xã, phường để các địa phương có căn cứ xây dựng phương án dồn đổi, tích tụ và tập trung đất đai phát triển sản xuất nông nghiệp.

Phòng Tài chính - Kế hoạch tham mưu UBND thị xã xây dựng kế hoạch bố trí kinh phí thực hiện việc dồn đổi, tích tụ và tập trung đất đai .

Văn phòng Đăng ký quyền sử dụng đất thị xã tổ chức thực hiện kịp thời việc đo đạc, chỉnh lý hồ sơ địa chính, cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất cho các hộ theo quy định.

Phòng Văn hóa thông tin và Đài truyền thanh thị xã mở các đợt tuyên truyền, phổ biến sâu rộng trong nhân dân về kế hoạch dồn đổi, tích tụ và tập trung đất đai; kịp thời đưa tin biểu dương những địa phương, đơn vị làm tốt và phê bình những đơn vị chưa hoàn thành kế hoạch.

Mặt trận Tổ quốc Việt Nam thị xã và các tổ chức chính trị xã hội xây dựng chương trình, kế hoạch vận động đoàn viên, hội viên tích cực hưởng ứng và thực hiện dồn đổi, tích tụ và tập trung đất đai phát triển sản xuất nông nghiệp.