Trong đó có 12 mỏ sắt;  09 mỏ caolin-fenspat; 03 mỏ talc;  01 mỏ sepentin. Quá trình cấp giấy phép khai thác khoáng sản không thuộc danh mục khoáng sản làm vất liệu xây dựng thông thường được Bộ Tài nguyên và Môi trường phê duyệt tại Quyết định số 168/2003/QĐ-BTNMT ngày 19/02/2003 để UBND tỉnh Phú Thọ tổ chức quản lý và cấp giấy phép khai thác tận thu đối với các mỏ khoáng sản Cao lin-fenspat và khoáng chất công nghiệp. Các mỏ quặng sắt nằm ngoài diện tích điều tra, thăm dò, khai thác theo Quyết định số 116/2007/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính Phủ và được thỏa thuận cho phép của các Bộ: Công thương, Xây dựng, Tài nguyên và Môi trường, Văn phòng Chính phủ. Sau khi được UBND tỉnh Phú Thọ cấp Giấy phép khai thác khoáng sản, 25 mỏ đều đã thực hiện đầy đủ các hồ sơ thủ tục và tiến hành đầu tư xây dựng cơ bản mỏ, đưa mỏ vào khai thác. Tính đến thời điểm tháng 12/2014 thì 25 mỏ hoạt động  khai thác, chế biến khoáng sản đã đầu tư đạt: 1.249,91 tỷ đồng (Các mỏ Caolin-fenspats: 138,96 tỷ đồng; các mỏ sắt: 1.110,958 tỷ đồng). Thu nộp ngân sách nhà nước: 58,6 tỷ đồng (Cao lin-fenspat: 36,8 tỷ đồng; sắt: 21,8 tỷ đồng). Đóng góp an sinh xã hội tại địa phương 5,1 tỷ đồng.

Thời hạn cấp giấy phép khai thác khoáng sản không thuộc danh mục khoáng sản làm vất liệu xây dựng thông thường được cấp theo Luật Khoáng sản năm 1996 và Luật Khoáng sản sửa đổi bổ sung năm 2005, cấp giấy phép khai thác tận thu khoáng sản, thời gian cấp từ 3-5 năm. Sau khi Luật Khoáng sản năm 2010 có hiệu lực các mỏ đã chủ động thăm dò nâng cấp trữ lượng khoáng sản trong diện tích đã được cấp phép khai thác, làm cơ sở gia hạn giấy phép khai thác; tuy nhiên khoản theo khoản 2, Điều 82 Luật khoáng sản năm 2010 thì  thẩm quyền ủy ban nhân dân cấp tỉnh cấp Giấy phép thăm dò khoáng sản làm vật liệu xây dựng thông thường, than bùn, khoáng sản tại các khu vực có khoáng sản phân tán, nhỏ lẻ đã được Bộ Tài nguyên và Môi trường khoanh định và công bố. Các giấy phép khai thác tận thu khoáng sản cấp trước đây không thuộc danh mục khoáng sản làm vất liệu xây dựng thông thường đã được cấp trước năm 2010 một số giấy phép đã hết hạn, thì các khu vực khoáng sản này chưa được Bộ Tài nguyên và Môi trường khoanh định và công bố khu vực phân tán nhỏ lẻ, do đó không thuộc thẩm quyền phê duyệt trữ lượng của UBND tỉnh. Để tạo điều kiện thuận lợi cho các Doanh nghiệp đã đầu tư khai thác, chế biến khoáng sản trên địa bàn tỉnh Phú Thọ theo tinh thần Nghị quyết của Chính phủ về những giải pháp chủ yếu tập trung kiềm chế lạm phát, ổn định kinh tế vĩ mô, bảo đảm an sinh xã hội và tháo gỡ khó khăn cho sản xuất kinh doanh, hỗ trợ thị trường tiếp tục hoạt động; phát huy hiệu quả nguồn vốn đã đầu tư của các Doanh nghiệp vào khai thác mỏ. UBND tỉnh Phú Thọ đã báo cáo Bộ Tài nguyên và Môi trường, Bộ Công Thương, Bộ Xây dựng về đề nghị Bộ Tài nguyên và Môi trường công bố khu vực có khoáng sản phân tán, nhỏ lẻ trên địa bàn tỉnh Phú Thọ bao gồm cả các mỏ đã cấp giấy phép khai thác trước 1/7/2011 để đi vào hoạt động. Trong thời gian vừa qua các Doanh nghiệp đã chủ đông thăm dò nâng cấp trữ lượng khoáng sản trong khu vực được cấp phép khai thác. Đã có 15 mỏ đã hoàn thành công tác thăm dò, có hồ sơ báo cáo kết quả thăm dò. Trong đó: có 06 mỏ sắt; 06 mỏ caolin-fenspat; 01 mỏ sepentin; 02 mỏ talc; 04 mỏ đang thăm dò, 06  mỏ chưa có thông báo chương trình khối lượng thăm dò. UBND tỉnh Phú Thọ đã đề nghị Bộ Tài nguyên và Môi trường xử lý kết quả thăm dò nâng cấp trữ lượng ở một số khu vực đã được cấp phép khai thác trước đây. Bộ Tài nguyên và Môi trường đã có văn bản chỉ đạo về việc xử lý kết quả thăm dò nâng cấp trữ lượng trong khu vực được cấp phép khai thác khoáng sản tại tỉnh Phú Thọ. Sở Tài nguyên và Môi trường đã mở Hội nghị thẩm định kỹ thuật của Báo cáo kết quả thăm dò bổ sung và nâng cấp trữ lượng  theo quy định chuyển Hồ sơ kết quả thăm dò về Bộ Tài nguyên và Môi trường để xem xét, xử lý kết quả thăm dò nâng cấp trữ lượng trong khu vực được cấp phép khai thác khoáng sản tại tỉnh Phú Thọ. Kết quả tài liệu thăm dò nâng cấp trữ lượng trong khu vực được cấp phép khai thác đợt 1gồm 6 hồ sơ. Trong đó có 5 giấy phép khai thác đến nay đã hết hạn, 01 giấy phép còn hạn. Tổng cục Địa chất và Khoáng sản Việt Nam, Văn phòng Hội đồng đánh giá trữ lượng khoáng sản quốc gia đã xem xét và trình Hội đồng đánh giá trữ lượng khoáng sản quốc gia tại phiên họp hội đồng ngày 21/01/2015. Thứ trưởng Trần Hồng Hà Phó Chủ tịch Hội đồng đánh giá trữ lượng quốc gia đã có thông báo về việc đánh giá tài liệu thăm dò, yêu cầu các doanh nghiệp rà soát, chỉnh sửa, bổ sung theo văn bản thẩm định và của hội đồng tư vấn Phú Thọ, Tổng cục địa chất và khoáng sản Việt Nam, Văn phòng Hội đồng đánh giá trữ lượng khoáng sản quốc gia sau đó trình Hội đồng đánh giá trữ lượng khoáng sản quốc xem xét, phê duyệt. Riêng mỏ Sắt xã Tân Phú, huyện Tân Sơn giấy phép chưa hết hạn chỉnh sửa, bổ sung trình UBND tỉnh phê duyệt.

Đến nay các Doanh nghiệp đang khẩn trương hoàn thiện hồ sơ, trình các cấp có thẩm quyền phê duyệt, kết quả thăm dò nâng cấp trữ lượng trong khu vực đã được cấp phép khai thác làm căn cứ xem xét, quyết định đầu tư và gia hạn giấy phép khai thác khoáng sản theo quy định.