Do ảnh hưởng cơn bão số 4 từ ngày 28  đến  30/8/2019 trên địa bàn huyện Thanh Sơn xảy ra mưa lớn trên diện rộng (tổng lượng mưa có nơi trên 178mm) lũ trên một số sông, suối lên rất nhanh, có nơi cao hơn mức lũ lịch sử năm 1961 và năm 1971 tại các xã Võ Miếu, Địch Quả, Thục Luyện, Sơn Hùng và thị trấn Thanh Sơn. Mưa to gây thiệt hại rất lớn đối với người dân huyện Thanh Sơn, đặc biệt là tại thị trấn Thanh Sơn và xã Sơn Hùng. Ngay sau khi lũ rút, UBND huyện Thanh Sơn giao phòng Tài nguyên và Môi trường phối hợp với Chi đoàn khối cơ quan Chính quyền huyện tổ chức ra quân dọn dẹp vệ sinh môi trường tại các khu vực bị thiệt hại nặng sau hoàn lưu cơn bão số 3 như: Phố Khánh, Phú Gia, Hùng Nhĩ, Hoàng Sơn, Tân Thịnh và  trụ sở Ủy ban nhân dân huyện nơi nước lũ đi qua. Đồng thời, triển khai các biện pháp thu gom rác thải, bùn đất đảm bảo vệ sinh môi trường tại các khu vực có nguy cơ gây ô nhiễm như: bãi chôn lấp rác thải; thuốc bảo vệ thực vật; khu vực bệnh viện, trạm xá, khu dân cư tập trung... Bên cạnh đó, hai đơn vị đã phối hợp hướng dẫn nhân dân khu vực bị ảnh hưởng do mưa, lũ vệ sinh nhà cửa, khơi thông cống rãnh, vệ sinh đường phố, thôn, xóm thu gom bùn đất, xác động vật... đưa đi xử lý; tiến hành tiêu độc, khử trùng các giếng nước sinh hoạt và bể nước cấp; tiến hành phun thuốc khử khuẩn, diệt côn trùng tại các trường học, chợ... khu vực bị ngập, lụt; cấp phát thuốc khử khuẩn và hướng dẫn các hộ dân thực hiện vệ sinh tiêu độc, khử trùng; san gạt thu gom đất đá bị sạt lở trên các tuyến đường giao thông. Đến nay, cơ bản huyện Thanh Sơn đã khắc phục xong tình trạng ô nhiễm môi trường do ảnh hưởng của lũ lụt gây ra. Trong thời gian tới huyện tiếp tục chỉ đạo các đơn vị liên quan khẩn trương kiểm tra, theo dõi thường xuyên tình hình ngập lụt, công tác đảm bảo nước sạch dùng cho ăn uống, sinh hoạt của người dân, tình hình vệ sinh môi trường và quản lý chất thải trong các cơ sở y tế trên địa bàn; thường trực sẵn sàng tham gia ứng phó về công tác y tế, khắc phục hậu quả do bão, xử lý môi trường và phòng chống khi có dịch bệnh xảy ra.